L’autel principal en marbre polychrome a été réalisé selon les plans de Valentino Martelli; elle fut achevée vers 1610. Martelli était un interprète habile de la leçon de Michelangelo, qu’il avait réussi à combiner avec une sobriété nettement réformée. il a commencé son activité à San Pietro en 1591 en planifiant la rénovation de l’intérieur et la construction d’un cloître en face de la basilique. L’autel, qui abrite les restes de saint Pierre Vincioli, est surmonté d’un riche et précieux ciboire monumental, en jaspe et en marbre vert ancien, commandé en 1621 par l’abbé Alessandro Pacognani au sculpteur toscan Sante Ghetti qui l’exécute à Rome pour le paiement de 124 scudi. Ghetti s’installe dans l’urbe au cours de la deuxième décennie du XVIIe siècle et est embauché comme tailleur de pierre dans la Fabbrica di San Pietro après avoir été en contact avec les sculpteurs du cercle étroit de Bernin.