Nella Cappella del Sacramento si possono ammirare tre dipinti del pittore, architetto e storiografo aretino Giorgio Vasari. Preziose espressioni del manierismo cinquecentesco, importato a Perugia da uno dei più fedeli stimatori di Michelangelo, le tele testimoniano il magistero di Vasari nella pittura, arte nella quale si era già cimentato nel Palazzo della Cancelleria a Roma, nel refettorio della Chiesa di Sant’Anna dei Lombardi a Napoli, nella Sala dei Cinquecento a Palazzo Vecchio in Firenze.